هماتوکسیلین (Hematoxylin) یک رنگ طبیعی استخراجشده از چوب درخت هماتوکسیل است و معمولاً بهصورت پودر یا محلول آماده مصرف عرضه میشود. این ماده پس از اکسید شدن به هماتوکسیلین (Hematoxylin Oxidized) یا هماتین تبدیل میشود که قادر است با فلزات (مانند آلومینیوم در هماتوکسیلین آلومینیوم) کمپلکس تشکیل دهد و هسته سلولها را به رنگ آبی یا بنفش مشخص کند.
هماتوکسیلین یکی از پرکاربردترین رنگها در هیستولوژی و پاتولوژی است و معمولاً بهعنوان رنگ اولیه در روشهای رنگآمیزی مانند H&E (هماتوکسیلین و ائوزین) استفاده میشود تا هسته سلولها و ساختارهای هستهای به وضوح مشاهده شوند. این ماده همچنین در مطالعات آموزشی و تحقیقاتی برای بررسی مورفولوژی سلولی و بافتشناسی کاربرد دارد.
هماتوکسیلین باید در شرایط خشک، خنک و دور از نور مستقیم نگهداری شود تا کیفیت و قدرت رنگآمیزی آن حفظ شود.