تریس هیدروکلراید به عنوان منبع یون کلرید و اسیدیکننده در تهیه بافرهای تریس عمل میکند و معمولاً با تریس بیس ترکیب میشود تا بافرهایی با pH دقیق (معمولاً ۷.۲ تا ۸.۸) ایجاد شود. این ترکیب به دلیل خلوص بالا و عدم تداخل با واکنشهای آنزیمی، در الکتروفورز پروتئین و نوکلئیک اسید (SDS-PAGE، Agarose gel)، بافرهای running و stacking، استخراج و خالصسازی DNA/RNA، کشت سلولی، ایمونواسیها (مانند ELISA و وسترن بلات) و کروماتوگرافی پروتئین کاربرد گسترده دارد. در صنایع دارویی برای پایدارسازی پروتئینهای درمانی، فرمولاسیون واکسنها و داروهای بیولوژیک استفاده میشود. تریس هیدروکلراید نسبت به تریس بیس پایداری بیشتری در ذخیرهسازی دارد و به راحتی در آب حل میشود، اما باید توجه داشت که pH محلول آن با تغییر دما به طور قابل توجهی تغییر میکند.